מינהל התכנון אחראי על ייזום וקידום שורה ארוכה של תכניות אב ומתאר חדשות ליישובים בהם נדרש עדכון לתכנית קיימת או לישובים שאין להם תכנית. מנהל התכנון מנהל את תהליך קידום התכנית לכל אורך השלבים התכנוניים והסטאטוטוריים עד לאישור במוסדות התכנון הרלבנטיים. הליך קידום התכנית נעשה בשיתוף מלא עם הנהגת היישוב, במסגרת של ועדת היגוי, בה חברים נציגי גורמים רבים נוספים כמו משרדי הממשלה השונים, מינהל מקרקעי ישראל והגופים הירוקים. נכון להיום האגף מקדם 64 תכניות אב ומתאר.

בנוסף, אושרו עוד 106 תכניות אב ומתאר אשר קודמו על ידי מינהל התכנון (לחלק מהישובים אושרו גם תכנית אב וגם תכנית מתאר).

במסגרת זו מקדם מנהל התכנון גם שורה של נושאי רוחב בינמשרדיים. בין הנושאים - עידוד שיתוף פעולה אזורי בדגש על נושא אזורי תעסוקה משותפים (יהודי-ערבי), לימוד ושכלול נושא שיתוף הציבור ואופן השילוב המיטבי של נושא השימור והנושא הסיסמי בתכניות המתאר.

תכנון במגזר הערבי

האגף לתכנון מקומי מוביל בשנים האחרונות מהלך חסר תקדים של הכנת תכניות אב ומתאר ליישובים הערביים בישראל, בהתאם לשורה של החלטות ממשלה. מטרת הפרויקט הינה שיפור איכות החיים ביישובים אלה, לרבות תוספת ניכרת של שטחים למגורים, מבני ציבור, אזורי תעסוקה, שטחים פתוחים ותשתיות ברמה נאותה כעתודה לצרכי היישוב לטווח הארוך

פרויקט התכנון במגזר הערבי כולל למעלה מ- 70% מהישובים הערביים בישראל.

כמו כן, מקדם האגף 6 תכניות מפורטות לאיחוד וחלוקה בישובי הבדואים בצפון הארץ, במטרה לסייע ביישום התכנון המתארי.
תכנון במגזר היהודי

האגף לתכנון מקומי מקדם בימים אלה תכנית מתאר ל-  21 ישובים יהודים ומעורבים, זאת בנוסף לתכניות שכבר אושרו. בניהם ערים גדולות כדוגמת חיפה, עכו, חדרה, אילת ועוד.