המחלקה לביקורת ראיית חשבון אחראית על מינוי רואי חשבון לביצוע ביקורות בשלטון המקומי לפי תכניות ביקורת מוגדרות מראש. קבלת דוחות הביקורת, בדיקתם, אישורם והפצתם לרשות המקומית, למשרד הפנים ולמשרד מבקר המדינה.
פרסום דוחות ביקורת באינטרנט ובספרים. מתן חוות דעת מקצועיות למקבלי החלטות במשרד הפנים. 

ראשי הרשויות המקומיות מתבקשים לדווח בתוך שבועיים על הנסיעות לחול של עובדי ונבחרי הרשויות.

הדיווח יעשה בקובץ הEXCEL שלהלן.

את הקובץ המלא יש לשלוח לפי ההנחיות המצורפות.

תפקידה של המחלקה לערוך ביקורות כלליות ואופקיות בשלטון המקומי בהתאם לתוכנית עבודה שנתית וביקורות מיוחדות כחלק מתהליך קבלת החלטות של הנהלת המשרד. הביקורות נערכות על ידי עובדי המחלקה על פי קריטריונים אחידים ובמסגרתן נבדקים מגוון של נושאים ותחומי פעילות מרכזיים ברשות המקומית ובגופים הנלווים כגון: חברות כלכליות, איגודי ערים וועדות מקומיות לתכנון ולבנייה.  

הוועדה הוקמה על רקע הצורך לפעול לשינוי שיטת הרישום והדיווח הכספי ברשויות המקומיות על פי המלצות "ועדת ברנע".

בתפקיד יו"ר הוועדה כיהן ד"ר שוקי אמרני ובה היו חברים נציגים של משרד הפנים, משרד האוצר, לשכת רואי חשבון ומרכז השלטון המקומי.

דוח הוועדה שהוגש בשנת 1999 ואומץ ע"י הנהלת משרד הפנים, כולל המלצות במגוון תחומים בנוגע לדרך הראויה בתהליך יישום השינוי בשיטת הרישום והדיווח הכספי כך שייעשה באופן הדרגתי בהתחשב במאפיינים של השלטון המקומי מחד ובצרכים של השלטון המרכזי מאידך, ותוך בחינה קפדנית של המשמעויות, כדי למנוע פגיעה בהתנהלותן השוטפת של הרשויות המקומיות ובבסיס הנתונים בתהליך קבלת ההחלטות.